Assim, não pensei muito na geologia da coisa, mas sei que tem explicação. Só acho que não precisamos discutir mto isso. De qq forma, sim, teoricamente os lagos estariam numa região mais elevada (por estar no topo do vulcão), mas não penso em nada de altitudes quilométricas.
Pelo tamanho do lago, não diria que seria ele todo seria de águas termais. Provavelmente teríamos bolsões isolados próximo de fissuras e seu leito com certeza ocultaria antigas e enormes cavernas de magma, possivelmente direcionando até o centro ativo do vulcão, onde uma sociedade oculta de criaturas das chamas vivem... ... ... ... viajei...
Enfim, até mesmo se dissermos que o lago faz ligação com o mar por algum túnel subterrâneo que corre por todo o continente, eu garanto que há uma explicação plausível e cientificamente atestada de que o nível do mar não afetaria as águas do lago ou sua salinidade baixa. Até justificaria a constante renovação das águas, impedindo que o lago se torne uma banheira fervente.
Tá... no final acabei pensando na geologia da coisa.