Eu sou ateu, mas...
Se tudo está no plano do cara isso também está, e se está tem um propósito e se tem um propósito qual é ele?
Permitir que as pessoas sejam boas por escolha própria? Ou ainda, "testar" a fé das pessoas?
O livre-arbítrio não resolve o problema - só adiciona mais uma camada de problemas à Teodiceia. Deus não só permitiu a existem da maldade, quando criou um mecanismo incrivelmente eficaz para assegurar que humanos irão para ela.
Depende. Você afirma que a manutenção das liberdades individuais deve ser uma guia para decisões dos governantes, não? Deus poderia retirar (ou melhor, não dar) o livre arbítrio, garantindo que nenhum ser humano fizesse o mal. Mas nesse caso Ele é que estaria sendo mau, por negar a liberdade ao ser humano.
Eu não vejo incompatibilidade entre o Bom, Onipotente e Onisciente. Ele vê que o mal está sendo feito, pode eliminar esse mal se quiser, mas não o faz. Para qualquer imediatista isso pode parecer prova que ele não é bom, mas pra mim apenas é sinal de que para deus "os fins justificam os meios" (pensamento muito comum entre seus seguidores, pelo visto). O mal que as pessoas sofrem hoje é insignificante perto da eternidade de paz e boa-venturança que terão no pós-vida.
Uma que gosto de dizer a religiosos é que a culpa do pecado existir no mundo é de Deus e eles se veem surpresos até eu demonstrar que se não houvesse a árvore do bem e do mal, o home não comeria do fruto e assim não haveria queda...
Mas aceitar isso exige acreditar que realmente existiu uma árvore (literalmente), proibida e shit, e que na época realmente existia só Adão e Eva e tudo o mais. Há um limite no que podemos continuar discutindo em cima de metáforas.