Então... Me corrijam se eu estiver errado

Cada lente tem sua Distância Focal, a dessa lente que você tem é de 0,2m, ou seja, menos do que 20cm a imagem não vai focar...
Link: http://www.usa.canon.com/cusa/consumer/products/cameras/ef_lens_lineup/ef_s_60mm_f_2_8_macro_usm#Specifications

Mas acho que não é exatamente isso que vc quer saber, então:

Não sei se isso justifica o focar/desfocar do assunto na frente ou no fundo da foto... Acho que a própria lente faz isso!
O que vc pode tentar fazer é aumentar a abertura focal. O mínimo dessa tua lente é 2.8, tenta jogar esse número o mais alto possível! (sabe como fazer?)

O que acontece, quando você deixa ele baixo (2.8), ele vai focar na frente e desfocar no fundo (basicamente...) e quando você joga o número pra cima (10... 15... ) ele vai focar cada vez mais coisas...

Acho que funciona mais ou menos assim, quanto menor for a distância focal, menos ela vai focar (jura?) e quanto maior for, mais ela vai focar xD

Eu recomendaria você comprar uma lente fixa, sempre ouço que as melhores são as que ficam entre 75mm e 100mm, mas elas são um pouco caras e tem bastante zoom, o que poderia quebrar um galho (e ser barato) é a 50mm 1.8, que vc acha no ML por preços em torno de 400, 500 reais...

Então eu acho que não entendi o teu problema :T

Tu não ta conseguindo focar um objeto de 3 cm?

Usa o Auto-foco, pode ajudar!

E a distância focal é essa que eu falei, de 20 cm, menos que isso vai ser complicado mesmo :T

Agora eu entendi perfeitamente o problema!

Eu não sei como você pode fazer isso em uma Macro, pois nunca tive uma, mas sei que nas lentes de Zoom você tem a abertura focal mínima de 5.6 e máxima de sei lá quanto, então tu tem que deixar esse número o mais alto possível!

Você já tentou fazer isso?

Essa tua lente se nao me engano é 2.8, tenta jogar o maior valor possível aí!

Beleza :D

Se der certo avisa aí ^^